Биохимики из Washington University in St. Louis разработали новый тест под названием EndoVIA, который позволяет точно отслеживать отдельные изменения в клетках. Это достижение может значительно углубить наше понимание причин возникновения многих заболеваний, сообщает ACS Central Science.
Одной из ключевых модификаций РНК является редактирование аденозина в инозин (A-в-I), которое катализируется ферментами аденозиндезаминазами, действующими на РНК (ADAR). Эти модификации различаются в разных типах тканей и необходимы для множества биологических функций. Нарушение их регуляции может приводить к развитию аутоиммунных и неврологических расстройств, а также рака.
Недавние исследования показали связь между локализацией РНК в клетке и редактированием A-в-I, однако механизмы, лежащие в основе этой связи, до сих пор изучены недостаточно. Современные методы изучения РНК, как правило, предполагают извлечение РНК из клеток, что может искажать данные о ее субклеточной локализации и разнообразии.
Чтобы решить эту проблему, ученые перепрофилировали эндонуклеазу V (EndoV) — магний-зависимую рибонуклеазу, которая расщепляет основания инозина в отредактированной РНК. Это позволило создать метод для селективного связывания и обнаружения отредактированной A-в-I РНК непосредственно в клетках. Новый метод, названный EndoVIA, обеспечивает пространственную визуализацию отредактированных транскриптов, позволяет быстро оценить общее содержание инозина и отображает ландшафт редактирования A-в-I в транскриптоме на наноскопическом уровне.
Это открытие представляет собой важный шаг вперед в области молекулярной биологии и медицины, открывая новые перспективы для исследований и лечения различных заболеваний.
