Согласно архивным данным, в период с 1899 по 1905 годы в регионе действовала первая группа медицинских работников.
В 1908 году в поселке Пржевальск был открыт военный госпиталь, рассчитанный на 48 коек, где трудились один врач, два фельдшера и акушер. Финансирование осуществлялось за счет местного бюджета. Госпиталь имел четыре палаты, приемную, аптеку и кабинет врача.
Медицинские работники работали без выходных и принимали пациентов круглосуточно. В то время у населения были выявлены случаи оспы, тифа, малярии, туберкулеза и других инфекционных заболеваний.
По постановлению Народного комиссариата здравоохранения РСФСР от 2 июля 1925 года, бесплатную медицинскую помощь получали государственные служащие, их семьи, члены профсоюзов, военнослужащие и инвалиды труда.
Согласно решению исполнительного комитета Кыргызской автономной области от 13 сентября 1925 года, во всех медицинских учреждениях помощь населению также предоставлялась бесплатно.
Партийные организации и исполнительные комитеты активно работали над увеличением числа медицинских учреждений и улучшением качества оказываемых услуг.
В 1926 году в Караколе функционировала больница с 30 коечными местами и 6 штатными единицами; в венерологическом диспансере работали два врача.
Руководителем отдела здравоохранения был Петр Ильич Смородин, а с мая 1924 года его возглавлял Иван Алексеевич Лаженицын, окончивший Казанский университет.
В течение многих лет в местных больницах трудились врач Вольдемар Бекман и гинеколог Мария Ефимовна Хахалева, которые были супругами. За тридцать лет работы в здравоохранении они были награждены многими государственными наградами.
В 1928-1929 годах в больнице Каракола уже насчитывалось 60 коек: 22 в терапевтическом отделении, 38 — в хирургическом, и 10 в родильном отделении. В 1930 году в роддоме было добавлено еще 10 коек.
Также в 1928 году была открыта больница в Сазановке, рассчитанная на 15 коек, где работал один врач, фельдшер и акушер.
В Тюпском районе в отремонтированном старом здании была открыта больница на 15 коек. Со временем медицинские учреждения появились в Покровке, Кольцовке, Чолпон-Ате, Ново-Вознесеновке и Уйтале (по документам).
По статистике, в 1927-1928 годах в Покровке было принято 6852 пациента, в Кольцовке — 10328, в Чолпон-Ате — 3331, в Ново-Вознесеновке — 3857, а в Уйтале — 1437 пациентов.
21 ноября 1939 года указом Президиума Верховного Совета СССР была образована Иссык-Кульская область и создан областной отдел здравоохранения.
