Сеть атласа клеток BRAIN Initiative® (BICAN) выпустила свой первый крупный релиз данных, что стало важной вехой в амбициозных усилиях по картированию всего человеческого мозга.
Данные, доступные через BICAN Rapid Release Inventory, включают одноклеточные и одноядерные транскриптомные и эпигеномные профили людей, мышей и 10 других видов млекопитающих. Полученные из нескольких грантов и лабораторий в рамках консорциума, включая Институт Аллена, эти данные взяты из проектов, направленных на идентификацию и определение типов клеток мозга на основе молекулярных профилей.
«Кран открыт, данные поступают, и их будет еще больше», — сказала Кэрол Томпсон из Института Аллена. «Мы надеемся, что если мы сможем поощрять повторное использование и обмен данными между несколькими лабораториями, мы сможем максимально увеличить ценность этих наборов данных и действительно увеличить государственные инвестиции в исследования».
Эта работа финансируется программой исследований мозга посредством продвижения инновационных нейротехнологий® Национального института здравоохранения или инициативой BRAIN®. BICAN объединяет нейробиологов, вычислительных биологов и инженеров-программистов для создания всеобъемлющего атласа человеческого мозга. Эта работа основывается на более ранних проектах, финансируемых программой NIH BRAIN Initiative в Институте Аллена и других местах, в которых были картированы клетки всего мозга мыши и частей человеческого мозга путем изучения генов, активных в отдельных клетках.
«Этот релиз представляет собой важный шаг вперед на пути к новому рубежу нейронауки, где мы наконец начнем понимать, что отличает человеческий мозг от других», — сказала Фенна Кринен из Принстонского института нейронауки.
«Объединяя экспертов из разных областей, проект BICAN является моделью открытой науки», — сказал Джон Нгай из NIH BRAIN. «Доступность этой быстрорастущей сокровищницы данных позволит исследователям по всему миру продвигать эту область к более глубокому пониманию человеческого мозга как в здоровом состоянии, так и в состоянии болезни, в конечном итоге прокладывая путь к более точным методам лечения и излечения разрушительных заболеваний мозга».
Публикация открытых данных призвана ускорить открытия в области нейронауки, предоставляя беспрецедентный доступ к необработанным данным из мозговых клеток разных видов и стадий развития. Традиционно могут пройти годы между тем, как ученый сгенерирует данные, и тем, как эта информация станет доступной через опубликованную статью.
Эта инициатива знаменует собой отход от этого традиционного подхода, отдавая приоритет раннему обмену данными для содействия сотрудничеству и ускорения исследований. «Я надеюсь, что эта модель станет нормой, когда мы выпускаем данные до их публикации и работаем вместе, чтобы создавать ресурсы для всего сообщества», — сказал Кринен.
Теперь исследователи могут использовать этот открытый набор данных для картирования и определения типов клеток мозга, предлагая новые идеи о разнообразии и функциях клеток мозга. «Нейронаука — сложная область», — сказал Томпсон. «Чем больше мы сможем сделать, чтобы полученные нами данные подпитывали больше исследований и помогали обществу, тем лучше для нас».
