Продолжающееся наблюдение за постоянно меняющимся вирусом SARS-CoV-2 оказалось решающим в нашей борьбе с пандемией COVID-19. Оно не только помогает в выявлении новых вариантов, но и в отслеживании их распространения и разработке целевых вакцин. Похожий подход используется при разработке ежегодных прививок от гриппа.
Однако для этого начинания необходима хорошо структурированная система наименований для новых вариантов, чтобы обеспечить универсальное понимание и коммуникацию между всеми сторонами, участвующими в изучении и отслеживании вирусов. До сих пор вирус денге, наиболее распространенное заболевание, переносимое комарами, в мире, с более чем 12 миллионами зарегистрированных случаев только в этом году, не имел эффективной системы наименований.
Теперь группа исследователей из Йельского университета и ученых из 14 других стран представила новую систему линий лихорадки денге. Эта система готова произвести революцию в отслеживании и разработке вакцин. Их выводы, подробно изложенные в исследовании, опубликованном в уважаемом журнале PLOS Biology, знаменуют собой значительный шаг вперед в нашей борьбе с лихорадкой денге.
Вирус денге, переносимый комарами, представляет значительную угрозу, поскольку может вызывать у инфицированных высокую температуру, сильные боли в теле, тошноту и изнурительную сыпь. Кроме того, в тяжелых случаях он может оказаться смертельным.
Хотя лихорадка денге наиболее распространена в тропическом и субтропическом климате, в последние годы в этих регионах наблюдается заметный рост вспышек. Тревожно, что вирус также распространился за пределы этих областей. В 2023 году Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) сообщила о почти 4,6 миллионах случаев заражения лихорадкой денге в Америке, что делает ее наиболее пострадавшим регионом. Шокирующе, но в этом году это число возросло до более чем 11,7 миллионов. Даже страны, которые исторически были избавлены от лихорадки денге, такие как США и Италия, теперь сталкиваются с угрозой вируса.
«С точки зрения общественного здравоохранения и с точки зрения разработки вакцины данные геномного надзора за вирусом денге крайне необходимы», — сказал Натан Грубо, доцент эпидемиологии (микробные заболевания) в Йельской школе общественного здравоохранения (YSPH) и старший автор исследования. «Но до сих пор способ, которым мы организовали геномные данные о вирусе денге, был слишком общим, чтобы предложить полезную информацию».
Исследователи долгое время боролись с проблемой категоризации и отслеживания различных данных, особенно в контексте геномного секвенирования вируса денге. Существующие разрозненные системы наименований привели к путанице и затруднили совместные усилия. Однако новаторское решение уже на горизонте.
Грубо и Верити Хилл возглавили глобальную инициативу по революционизации системы наименований вариантов вируса денге. Их инновационный подход включает переопределение стандартов генотипов и введение новых классификаций субгенотипов, прокладывая путь для более эффективного изучения и наблюдения за потенциально опасными вариантами.
Это монументальное усилие получило широкую поддержку международного исследовательского сообщества, что стало значительным шагом вперед в борьбе с инфекциями денге. По мере внедрения новых вакцин потребность в единой системе наименований никогда не была столь насущной.
«С широкими категориями может показаться, что регионы затронуты только одной или двумя версиями вируса», — сказал Хилл. «Но с этим повышенным разрешением мы начинаем видеть ряд линий, которые циркулируют вокруг регионов».
Международные коллеги единодушны в том, что эта новаторская система будет иметь решающее значение для эффективного мониторинга растущей вирусной угрозы.
«Новая система линий, которую мы разработали, предоставляет важнейший инструмент для понимания генетического разнообразия вируса денге и расширяет наши возможности отслеживания распространения и эволюции вируса», — сказал соавтор исследования Андерсон Ф. Бриту, вирусолог из Института All for Health в Сан-Паулу, Бразилия. «В таких странах, как Бразилия, где денге является серьезной проблемой общественного здравоохранения, эта система помогает выявлять новые линии и лучше прогнозировать последствия вспышек. Кроме того, она позволяет нам отслеживать, как вирусные линии могут влиять на эффективность новой вакцины против денге, впервые примененной несколько месяцев назад в Бразилии».
Кроме того, исследователи открыли веб-сайт, на котором представлена информация о новой системе наименований, предлагается доступ к исследовательским ресурсам и предлагается другим предлагать новые линии на основе собственных геномных исследований.
«У нас будет комитет, который будет собираться ежегодно для обозначения новых линий на основе предоставленных данных», — сказал Хилл.
